药智论坛

查看: 1527|回复: 0

DNA和蛋白质序列数据分析工具—薛庆中等编著2012.6出版

[复制链接]
发表于 2018-3-30 10:04:13 | 显示全部楼层 |阅读模式 来自 广东深圳
DNA和蛋白质序列数据分析工具(第三版)—薛庆中等编著2012.6出版


        近年来新一代测序技术的研发和应用,极大地推动了基因组科学的发展,也给基因组数据分析带来巨大的新挑战。薛庆中等编著的《DNA和蛋白质序列数据分析工 具(第3版)》对前两版原有内容做了大量更新和补充,全书17章,分别从基因组学、蛋白质组学、系统生物学三个层次详细介绍了常用的基因数据库和网络工 具;为适应Windows 7的环境,将BioPerl程序包的数据分析做了重排使其更易操作。尤其是增添了新一代测序数据分析实例,包括SNVs和Indel识别、小RNA- seq分析、枯草杆菌全基因组序列拼接:并对Bowtie等读序列定位工具和UCSC浏览器的使用做介绍。 《DNA和蛋白质序列数据分析工具(第3版)》内容深入浅出、图文并茂。书中提及的各种方法均有充实的例证并附上相关数据和图表,供读者理解和参考;书后 还附有中英文的专业术语和词汇。可作为对基因组学、蛋白质组学、生物信息学感兴趣的本科生、研究生和研究人员学习、研究的重要工具手册。


        薛庆中等编著的《DNA和蛋白质序列数据分析工具(第3版)》分8章。第1章阐述序列比较的核心方法,即运用BLAST和ClustalX等工具做序列比 对。第2章重点介绍了核苷酸序列分析工具,主要包括:基因预测、编码区结构分析、可变剪切分析、预测基因启动子等。第3章蛋白质氨基酸序列分析从搜索数据 库开始,随后对蛋白质基本理化性质、二级结构、结构域和三维空间结构、预测目标蛋白的生物功能等工具进行逐一介绍。第4章使用TM4软件可实现芯片的数据 采集,低质量过滤,标准化处理。第5章简介GeneOntology和KEGG数据库,将分别有助于挖掘基因和蛋白的功能及其代谢途径分析。第6章介绍分 子进化遗传分析工具包,用MEGA4绘制系统发生树,为研究基因进化打好基础。第7章利用X!Tandem软件鉴定蛋白质的串联质谱数据,再将质谱结果匹 配到蛋白质组数据库鉴定出蛋白,并借助TPP软件包进行统计学分析,优化检索结果。第8章介绍Cytoscape系统生物学分析软件,展示蛋白-蛋白相互 作用,并实现与基因表达等数据有机整合。书后附有专业词索引。
3.png
您需要登录后才可以回帖 登录 | 免费注册

本版积分规则

QQ|论坛规则|(渝)-经营性-2021-0017|渝B2-20120028|前往 违法和不良信息举报中心 举报|药智论坛 ( 渝ICP备10200070号-7

渝公网安备 50010802004459号

GMT+8, 2024-3-29 23:11

快速回复 返回顶部 返回列表