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探秘CRISPR技术:OneShine CRISPR/Cas9基因敲除细胞文库

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发表于 2017-9-2 16:57:20 | 只看该作者 |只看大图 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式 来自 广东广州
在张峰向国人展示CRISPR技术的神奇之处后,行业内可谓是炸开了锅,众多企业纷纷将目光投到这个领域之中,希望自己能成为生物行业内的那只“风口上的猪”,“出任CEO,迎娶白富美,走向人生巅峰”,这一切都看似触手可及!
进而,众多生物公司纷纷推出自己独特的CRISPR产品,然而众多的只是冠以“CRISPR”,改头换面,其本质还是一成不变!但在“量变引起质变”的定律下,像往圣生物公司等类型的公司在CRISPR技术上取得了令人可喜的成绩:OneShine CRISPR/Cas9基因敲除细胞文库。
什么是OneShine CRISPR/Cas9基因敲除细胞文库
以Lenti-CRISPR V2质粒为示例:
gRNA与Cas9蛋白结合于同一个载体上。我们设计合成了12万个gRNA(靶向约2万个基因),分别连接到Lenti-CRISPR V2载体上,然后把12万个质粒混合起来,形成CRISPR/Cas9 基因敲除质粒文库。并且我们将此文库整合到了细胞中,一个125cm2细胞培养瓶中含有约108个细胞,每个细胞被敲除了一个基因,共约2万个基因被敲除,所以含有每个特定基因缺陷的细胞约有5000个(108/2万)。客户拿到细胞后,可进行传代。
相关参数
靶基因物种:人
靶基因数目:19,050
gRNA数目: 123,411
细胞类型:胃癌、乳腺癌、结肠癌等癌细胞系和永生化的细胞系。
怎么应用OneShine CRISPR/Cas9基因敲除细胞文库
【应用举例:细胞凋亡相关基因筛选】
取细胞文库进行扩增,然后平均分成两份,每一份包含108个细胞,每个细胞被敲除了一个基因,共约2万个基因被敲除,所以含有每个特定基因缺陷的细胞约有5000个(108/2万)。向其中一份细胞中加入放线菌素D、诱导细胞凋亡(A组),在另一份细胞中加入溶剂、作为对照(B组)。A组用流式细胞仪筛选出凋亡细胞A1、未凋亡细胞A2,B组用流式细胞仪筛选出凋亡细胞B1、未凋亡细胞B2。分别对A1、A2、B1、B2进行短测序,检测哪些基因被敲除了。A2中被敲除的基因具有抗凋亡作用,B1中被敲除的基因具有促进凋亡的作用。其它应用:
1)新药靶点确定与验证
2)环状RNA上游调控机制分析
3)Long noncoding RNA作用机制验证
4)脂肪代谢机制研究
5)干细胞自我更新、不对称性分裂机制等。
像往圣生物公司这种类型生物公司,并不少见,难得的是在踏踏实实的做事!
     众观全局,CRISPR技术虽异军突起,让人措手不及,但在众多生物公司看来,这也可以说是“天上掉下来的馅饼”,大家的目的也都是一样:如何接到这块“馅饼”!但仅靠“擦边球”,没有核心技术,在这个年代是不靠谱的! 想靠CRISPR技术实现商业目的,还是要多走走心!

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风口上的猪

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Lenti-CRISPR V2质粒图谱如

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